(一)智力资本与公司法资本三原则的矛盾
按照公司法的经典原理，公司的资本，从经济上来说，是公司开展业务的物质基础;从法律上来说，是公司对第三人的最低财产担保。“资本三原则”即资本确定原则、资本维持原则、资本不变原则，是由公司法所确立的在公司设立、营运以及管理的整个过程中，为确保公司资本的真实、安全而必须遵循的基本的法律准则，是大陆法系经典公司法的基石。我国也遵循资本三原则。我国《公司法》在进行资本制度的设计时，将确保债权人利益和交易安全作为首要的价值目标。
然而，智力资本与资本三原则存在着矛盾。资本确定原则是指发起人在设立公司时，必须在公司章程中载明公司的资本总额，并由发起人和认股人全部认足或募足，否则公司不能成立。它有法定资本制、授权资本制和折衷资本制等实现方式。我国目前实行的是法定资本制原则。资本确定原则的立法目的在于确定资本的质量，保证公司资本的真实可靠，防止公司设立中的欺诈和投机行为。我国2006年1月1日实施的《公司法》第27条规定有限责任公司股东出资的方式包括货币、实物、知识产权和土地使用权。如果股东以知识产权出资的，由于我国新的《公司法》要求这些“非货币财产”必须是“可以用货币估价并可以依法转让”，因此，股东必须是该知识产权的合法拥有者，并经过法律程序的确认。股东以知识产权作价出资，必须对知识产权进行评估作价，不得高估或者低估作价，并应在公司办理登记注册之前办妥其转让手续。问题在于，我国目前只承认知识产权的资本性，对于其他形式的智力资本，如市场资本、人力资本、结构资本是不能作价出资的。
资本维持原则，是指公司在存续过程中，应当保持与其资本额相当的财产，其目的在于防止公司资本的实质减少，保护债权人的利益，同时也为了避免股东对公司盈利的过度分配，确保公司业务活动的正常进行。与此原则相适应，股东不得抽回股本，原则上公司不得持有本公司股份，利润分配有严格的程序，公司债券的发行也有严格的限制。资本不变原则指公司资本总额一经确定，非经法定程序不得随意变更，是为了防止公司任意减少资本，造成公司清偿能力的降低从而损害债权人的利益;或公司任意增加资本，使股东承担过多的风险，损害了股东的利益。
