第十六条 港口建设费的清算和会计核算
一、港口建设费在各港之间的清算，按港港结算办理，结算期限均为七天。
二、征收的国外进出口货物港口建设费，均由代征单位直接存入专户。由海关核准需经由水路运往国内其他港口的国外进口转运货物，海关放行的目的港是征收港口的，由目的港代征单位存入专户；否则，则解交给第一卸货港的代征单位存入专户。
三、征收的国内水运直达运输货物港口建设费，均由起运港代征单位存入专户。
四、征收的水水联运货物港口建设费，起运港是征收港口的，由起运港的代征单位存入专户，起运港不是征收港口时，则由起运港解交给第一个属于征收港口的代征单位存入专户。
五、征收的水铁联运货物港口建设费，由起运港代征单位存入专户。
六、征收的水铁水联运货物港口建设费，由起运港代征单位存入专户；起运港不是征收港口时，则由起运港解交给第二换装港的代征单位存入专户。
七、征收的铁水联运货物港口建设费，由到达港代征单位存入专户；到达港不是征收港口时，则由到达港解交给换装港代征单位存入专户。
八、征收的铁水铁联运货物港口建设费，由第一换装港的代征单位存入专户。
九、代收单位应向代征单位及时解交代收的费款，征收港口范围内的代收单位应于３日内向本港代征单位解交代收的港口建设费，其他代收单位按本条上述规定解交，不得截留、挪用。
十、代收或代征的港口建设费发生溢收需向缴费人退款时，代收单位用尚未解交代征单位的费款支付，代征单位用尚未存入专户的费款支付。
十一、港口建设费的会计核算
１．港口建设费的代征单位，应设立“应交港口建设费”一级会计科目，核算代征的港口建设费。代收单位可在“往来”科目中设置明细科目核算。
２．为了保证核算质量，防止错收漏收，及时解款，便于汇总和查核，征收港口建设费时，应将此项代征款在有关运输费收单据上单独填列。
通过“营业进款”科目核算收入的港口，对该科目中的港口建设费应及时分析，发现错误要及时追查，对费款要及时分配转入“应交港口建设费”科目；要按规定期限将收到的费款存入专户和向交通部解交。
第十七条 按《征收办法》第十二条和本施行细则第八条规定收取的罚款，应与港口建设费一并解交交通部。
