(五)医疗器械监管处。
监督实施医疗器械、卫生材料产品的法定标准和医疗器械产品分类管理目录；负责核发二类医疗器械产品注册证，复核注册产品标准；监督管理医疗器械临床机构；组织实施医疗器械质量体系考核，监督实施医疗器械生产、经营质量管理规范及认证工作；负责核发医疗器械生产、经营许可证及现场检查工作，负责一类医疗器械生产企业备案；负责组织医疗器械注册核查工作；负责医疗器械不良事件监测和再评价工作；指导医疗器械检测和技术审评机构的业务工作。
(六)药品安全监管处。
监督实施中药材生产、药品生产以及医疗机构制剂等质量管理规范；核发药品生产、医疗机构制剂许可证；按管理权限，承担药品委托生产的初审、审批和监督管理工作；承担药品生产及医疗机构制剂配制等许可的监督工作；配合实施国家基本药物制度，初审并推荐国家基本药物目录和非处方药物目录，初审处方药与非处方药转换评价；依法监管医疗用毒性药品、麻醉药品、精神药品、放射性药品、戒毒药品和药品类易制毒化学品的生产、使用；组织实施药品不良反应监测、药品再评价和淘汰工作。
(七)药品市场监管处。
监督实施处方药、非处方药、中药材、中药饮片的购销规则；监督实施
药品经营质量管理规范；依法核发药品经营许可证；依法对医疗机构药品使用实施监督；依法监管医疗用毒性药品、麻醉药品、精神药品、放射性药品、戒毒药品和药品类易制毒化学品的经营；监管中药材专业市场；监管互联网药品信息服务和交易行为；组织实施处方药与非处方药分类管理制度；负责药品、医疗器械广告的审批和监督。
(八)规划财务处。
拟订部门发展规划并组织实施；承担国家投资项目的初审、申报及实施中的管理工作；拟订局机关和直属单位财务管理制度并组织实施；编制局机关和直属单位经费预算、决算并监督执行；管理局机关和直属单位财务和资产，承担局机关日常财务核算工作；承担局机关和直属单位行政事业性收费的监督管理；承担局机关和直属单位内部审计工作。
(九)人事教育处。
负责局机关和直属单位干部人事、劳动工资、机构编制管理等工作；负责对外交流与合作工作；依法实施执业药师管理；承担食品、药品等相关从业人员的教育培训工作；对食品、药品等相关从业人员的食品、药品安全知识培训和健康检查进行监督检查。
离退休人员管理服务处。负责局机关离退休人员管理、服务工作，指导直属单位离退休人员管理、服务工作。
