第二阶段，自2013年至2015年，为三年巩固提升阶段。主要是深化实施大气污染防治各项措施，完成重点区域大气污染整治，实施周边城市区域联防联控；制订空气环境应急预案，全面做好2014南京青奥会空气质量保障；巩固提升大气污染防治成效，全面完成“十二五”规划环境目标，实现空气质量明显改善，灰霾天气有效减少，人民群众总体满意。
四、主要任务及分工
（一）加强工业企业废气污染防治
通过实施污染物减排与工业废气治理工程、关停淘汰落后产能、发展循环经济和推进清洁生产等措施，进一步提升工业企业的污染防治水平，有效削减主要大气污染物排放总量。
1、完成脱硫工程建设。全面完成国家和省下达的二氧化硫减排任务。2012年前，完成所有燃煤电厂脱硫工程，并实现设备稳定运行和达标排放。对容量65蒸吨/小时及以上锅炉优先实施脱硫，完成扬子石化、上海梅钢等10家以上重点企业主要设备烟气脱硫改造工程。对已建脱硫设施的工业企业实施整改，脱硫率全部稳定达到90％以上。2015年前，完成重点企业主要设备烟气脱硫改造工程。
责任单位：市环保局牵头，市经信委配合，相关重点企业负责。
2、加快实施脱硝工程建设。加快推进燃煤电厂脱硝工程建设，确保完成国家和省下达的氮氧化物减排任务。“十二五”期间，新、改、扩建火电机组必须配套建设烟气除尘、脱硫、脱硝系列设施。现役火电机组在采取低氮燃烧技术的基础上配套建设烟气脱硝设施，2012年前，单机容量30万千瓦以上的燃煤机组需完成脱硝工程，推动完成华能电厂等10家以上重点企业的烟气脱硝改造工程。2015年前，基本完成所有燃煤电厂脱硝工程。
责任单位：市环保局牵头，市经信委配合，相关重点企业负责。
3、整治关闭落后与污染严重水泥企业。按国家、省要求，逐步淘汰水泥产业的立窑、干法中空窑、立波尔窑、湿法窑水泥生产线，全面治理中国水泥厂、江南小野田等水泥企业粉尘污染。2012年前，关闭现存立窑生产线，淘汰一批20万吨以下小规模水泥企业。2015年前，淘汰完成所有产能落后的生产线和企业。
责任单位：市经信委牵头，市环保局配合，各区县政府负责。
4、淘汰钢铁企业落后产能。推动梅钢与南钢以新带老工程，淘汰落后产能。2012年前，基本完成小高炉、小焦炉淘汰工作，清理关闭所有不符合产业政策要求的生产线和钢铁企业。
责任单位：市发改委牵头，市经信委、市环保局配合，各区县政府负责。
5、强化工业废气治理。将石化、冶金、电厂等行业占全市大气污染负荷85%以上的工业企业列为重点整治对象，加强烃、醇、醛、酮、醚、酯、胺羧酸、芳香烃、酚类等有机化合物（碳氢化物）的回收利用与无害化处理，有效治理化工异味污染问题。2015年前，每年完成20个以上重点废气治理项目。
责任单位：市环保局牵头，各区县政府和相关企业负责。
6、加强挥发性有机污染控制。实施有机溶剂及挥发性有机化合物生产与使用登记报告制度，强化企业监管。2012年前，全面梳理石化、涂料、油墨、粘胶剂、喷涂、建筑、印刷、皮革制鞋、人造板制造、家具制造、汽车制造涂装和维修、电子产品制造、玩具制造、纺织印染等行业，建立重点企业监管名录，开展强制性清洁生产审核。2015年前，所有纳入名录的企业使用的溶剂必须符合环境标志产品技术要求，鼓励生产水性、低毒或低挥发性有机化合物排放的产品，淘汰挥发性有机化合物含量高的油漆、涂料产品，挥发性有机污染得到有效控制。
